Микросателлитная нестабильность (MSI)

10 рабочих дней

Что такое исследование MSI?

Это исследование определяющее микросателлитную нестабильность (изменение длины микросателлитов ДНК) в опухолевой ткани для диагностики и лечения онкологических заболеваний (колоректального рака, рака эндометрия и ряда других солидных опухолей).

Система репарации неспаренных оснований (MMR) —

это высококонсервативная система, отвечающая за распознавание и удаление ошибочно спаренных оснований, которые образуются в результате нарушений в процессах репликации и рекомбинации ДНК.

Когда работа MMR-системы нарушена, то происходит накопление ошибок и, как следствие, нарушение стабильности генома и появление множественных мутаций-триггеров канцерогенеза. Система MMR включает следующие белки [1]:

MSH2 MLH1 MLH3 PMS1 MSH6 PMS2 MSH3 Exo1

Микросателлиты

Короткие тандемные повторяющиеся последовательности ДНК от 1 до 4 пар оснований, распределенные по всему геному человека как в кодирующих, так и в некодирующих областях. Из-за своей повторяющейся структуры микросателлиты особенно подвержены ошибкам репликации [1].

Микросателлитная нестабильность (MSI)

Нарушение стабильности генома из-за дефектов в системе MMR (dMMR), характеризующееся широким спектром полиморфизмов длин микросателлитных повторов. Дефекты в системе MMR могут быть обусловлены герминальными (врожденными, синдром Линча), соматическими и эпигенетическими изменениями.

Синдром Линча

Генетическоe заболевание, ассоциированное с повышенным риском развития таких злокачественных новообразований, как колоректальный рак, эндометриальный рак, рак желудка, рак яичников и пр.

Подробнее

Для чего нужно исследование dMMR/MSI?

3.8%

солидных злокачественных новообразований

20%

случаев колоректального рака и рака желудка

26%

случаев рака эндометрия

характерна нестабильность микросателлитов (MSI-H/high статус), то есть имеют дефекты в системе репарации неспаренных оснований (dMMR).

90%

случаев колоректального рака обусловленного синдромом Линча также имеет высокий MSI (MSI‑H).

Распространенность MSI-H в различных опухолях *

*Bonneville R, Krook MA, Kautto EA, Miya J, Wing MR, Chen HZ, Reeser JW, Yu L, Roychowdhury S. Landscpe of Microsatellite Instability Across 39 Cancer Types.
JCO Precis Oncol. 2017;2017:PO.17.00073. dol: 10.1200/PO.17.00073. Epub 2017 Oct 3. PMID: 29850653; PMCID: PMC5972025.

Увеличить график

Согласно клиническим рекомендациям Минздрава РФ и NCCN (Национальной онкологической сети США) оценка статуса dMMR/MSI рекомендована пациентам с колоректальным и эндометриальным раком с целью:

определения прогноза,
определения тактики лечения заболевания,
повышения выявляемости пациентов с синдромом Линча [4, 9] .

dMMR/высокий уровень микросателлитной нестабильности (MSI-H) в опухоли является:

Прогностическим маркером
Предиктивным маркером, определяющим
- эффективность адъювантной терапии фторпиримидинами,
- чувствительность к терапии ингибиторами контрольных точек иммунного ответа (пембролизумаб, ниволумаб и пр.).

Маркером скрининга синдрома Линча. Пациентам с MSI-Н-опухолями, отвечающим диагностическим критериям Бетесда/Амстердамским II критериям, показано генетическое тестирование на синдром Линча в образце крови.

Как проводится диагностика dMMR/MSI?

На настоящий момент в лабораторной диагностике широко применяются два метода определения дефектов в работе системы репарации неспаренных оснований (dMMR):

Иммуногистохимический (ИГХ)

Оценка экспрессии белков 4 генов: MLH1, MSH2, MSH6, PMS2. Нормальным значением считается наличие экспрессии всех 4 белков. Потеря экспрессии ≥1 белков определяется как дефект системы MMR, и образец оценивают как MMR-дефектный (dMMR).

ПЦР и количественный капиллярный флуоресцентный электрофорез [8]

Оценка изменений длин определенных микросателлитных повторов. Панели микросателлитных маркеров могут варьировать от производителя к производителю и могут включать от 5–7 и более микросателлитных повторов.

Различия в составе и количестве маркеров в панели определяют различия в чувствительности и специфичности исследования.

90%

ожидаемая специфичность выявления случаев Синдрома Линча по оценке MSI‑статуса методом ПЦР

85%

чувствительность метода

Приняты следующие результаты оценки статуса MSI:

MSI-стабильный/MSI-S — нет локусов с нестабильностью
MSI-низкий/MSI-L
MSI-высокий (нестабильный)/MSI-H

Однако в последнее время MSI-стабильный и MSI-низкий результаты объединяют в MSI-стабильный статус, а в заключении указывают — микросателлитная нестабильность не обнаружена.

Лаборатория First Genetics проводит исследование MSI на расширенной панели маркеров, состоящей из:

13 микросателлитных локусов

BAT‑25

BAT‑26

BAT‑40

CAT‑25

NR‑21

NR‑22

NR‑24

NR‑27

ABI‑16

ABI‑17

ABI‑19

ABI‑20A

ABI‑20B

2 высокополиморфных пентануклеотидных локуса для идентификации образцов

PentaD

TH‑01

Преимущества расширенной панели

Отсутствие дополнительного контроля нормальной ткани

Нет необходимости использовать здоровую ткань/кровь пациента в качестве контроля
Малое количество исходной ДНК

Необходимо всего 2 нг ДНК, полученной из парафинового блока (FFPE)